El consejo se reúne una vez al año con el objetivo de analizar los resultados de las actividades realizadas, y aprobar el plan de trabajo correspondiente al siguiente año. Se encuentra integrado por los ministros de Infraestructura y Planeamiento de los países miembros. Según lo indica el artículo 7 del estatuto del COSIPLAN, la presidencia del consejo la ejerce el país que ocupa la presidencia pro témpore de UNASUR; salvo que previa propuesta de esta última, el consejo acuerde por consenso designar a otro país.
La vicepresidencia del consejo es ejercida por el país que ocupó la presidencia en el período anterior al vigente. Comité coordinador del COSIPLAN: El comité coordinador es la instancia ejecutiva de apoyo del COSIPLAN. Este comité es una pieza clave para el planeamiento y monitoreo de todas las acciones delineadas en el PAE.
Al estar integrado por delegadas y/o delegados ministeriales de los Estados miembros, se asegura que los proyectos y resultados reflejen las voluntades soberanas atendiendo las necesidades de todos los países. El comité coordinador es presidido por el país que ejerce la presidencia pro témpore (PPT) del COSIPLAN.
El Paraguay está representado en el comité a través del Ministerio de Obras Públicas y Comunicaciones (MOPC). Foro Técnico IIRSA La Iniciativa IIRSA en sus primeros diez años de trabajo, se constituyó como un foro esencial de los doce países para la planificación de la infraestructura del territorio suramericano con una visión regional y compartida de las oportunidades y obstáculos del subcontinente.
En el marco de IIRSA, por primera vez, América del Sur actuó como una unidad singular e integrada para crear una cartera de proyectos de infraestructura en los sectores de transporte, energía y comunicaciones. La conformación de la cartera de proyectos ha sido posible a partir del desarrollo y la aplicación de la metodología de planificación territorial indicativa. Esta metodología parte de la identificación de ejes de integración y desarrollo (EID), los cuales organizan el territorio suramericano y ordenan la Cartera de Proyectos. En 2011, la iniciativa IIRSA fue incorporada al consejo como su foro técnico, para apoyarlo en la planificación de infraestructura de conectividad regional.
Las coordinaciones nacionales (CNs) son el punto focal de cada país para la iniciativa IIRSA. Para contribuir al desarrollo de sus tareas, las CNs realizan reuniones periódicas, generalmente dos veces al año, para analizar los avances en los planes de trabajo anual aprobados por los ministros del COSIPLAN. Asimismo, trabajan de forma coordinada con el comité de coordinación técnica (CCT) en todo lo referente a las actividades de la Iniciativa.
Grupos de Trabajo
Los Grupos de trabajo del COSIPLAN (GT) se enfocan en aquellos temas que habiendo tenido un desarrollo técnico sólido, requieren de impulso en el plano político. El COSIPLAN cuenta con cuatro grupos de trabajo: Integración ferroviaria Mecanismos de financiamiento y garantías.
Telecomunicaciones.
Sistema de Información Geográfica (SIG) y página Web. Coordinaciones Nacionales Las Coordinaciones Nacionales (CNs) lideran la ejecución del plan de trabajo de COSIPLAN-IIRSA. Adoptan en cada país la organización interna que más convenga a sus características institucionales, y en todos los casos se define la figura del coordinador Nacional. El Coordinador Nacional de Paraguay es un funcionario del MOPC.